Historia firmy sięga 1983 roku. W początkowym okresie działalności firma zajmowała się projektowaniem, budową i montażem urządzeń oraz instalacji technologicznych głównie dla przemysłu spożywczego.

W 1995 r. rozpoczęła realizację strategii związanej z produkcją olejów i tłuszczów roślinnych. W 1996 r. w Czerninie k/Sztumu został uruchomiony Zakład Przerobu Rzepaku, w roku 2001 powstał nowoczesny Dział Rafinacji i Modyfikacji Olejów.

Po przekształceniach w styczniu 2004 roku firma zmieniła formę prawną ze spółki z ograniczoną odpowiedzialnością na spółkę akcyjną.

W maju 2004 roku akcje Elstar Oils zadebiutowały na Giełdzie Papierów Wartościowych w Warszawie.

W latach 2004-2006 znacząco rozbudowano moce przerobowe rzepaku, oraz moce produkcyjne w zakresie rafinacji i modyfikacji olejów. W 2006 rozpoczął prace nowy dział ekstrakcji oleju.

W 2008 r. Spółka zależna Biopaliwa S.A. rozpoczęła w zakładzie w Malborku produkcję biokomponentów do paliw silnikowych. W tym samym roku Grupa Elstar Oils zakończyła ostatni etap czteroletniego procesu inwestycyjnego, w wyniku którego moce produkcyjne w zakresie przerobu rzepaku rozbudowane zostały z 200 tys. do 400 tys. ton rocznie.